全球影响力:一亩心田,帝国理工学院如何利用 GPU 识别脑损伤

by 英伟达中国

编辑按:本文为介绍 NVIDIA 2016 年度全球影响力大奖五名决赛入围者的系列文章之一。NVIDIA 每年颁发 15 万美元给使用 NVIDIA 技术,在解决社会、人道与环境问题方面取得突破性进展的研究人员。

碰撞、击打和爆炸都会造成创伤性脑损伤,这正迅速成为一个首要的公共健康问题。

为了帮助诊断大脑这一人体最复杂器官的损伤,伦敦帝国理工学院的研究人员正在部署由 GPU 和深度学习支持的精密图像分析工具。

其中一支团队由该学院计算机系讲师 Ben Glocker 带领,他们的核心工作是探索计算方法。利用生物医学扫描得到的丰富数据,他们建立的系统能够自动进行基于图像的创伤性脑损伤评估,其评估速度是其他系统所无法比拟的。

Glocker 及其团队的工作让他们成为 NVIDIA 2016 年度全球影响力大奖决赛的五名入围者之一。NVIDIA 每年颁发 15 万美元给使用 NVIDIA 技术,在解决社会、人道与环境问题方面取得突破性进展的研究人员。

大脑受伤区域分割图像。
大脑受伤区域分割图像。

快速响应时间

虽然每年有数百万人遭受创伤性脑损伤,但大部分都不会危及生命。然而,任何扰乱大脑正常功能的伤害都会导致精神障碍或情绪问题,例如推理能力降低或抑郁症,而且还会造成未知的终身后果。

由于此类损伤复杂多样,因此很难识别和治疗。在医疗急救的过程中,快速响应是至关重要的,Glocker 在德国履行公共服务义务,担任救护车司机时亲眼见证了这一点。

GLocker 说:“医生需要看到器官和大脑发生的变化,并根据急诊室图像上的情况做决定。我们正在努力利用计算技术帮助医生做出更明智的决定。”

寻找各种模式

Glocker 团队的哲学博士生 Konstantinos Kamnitsas 和其他团队成员使用一种最成功的计算机视觉(卷积神经网络)深度学习技术开发出了图像分析技术,将数千个滤镜按顺序应用到图像中来寻找模式。

该团队将这些 GPU 加速计算工具应用到了 3D 医学扫描中。这种计算密集型大脑病灶分割方法是使用支持 cuDNN 的 Python 库开发的,这种 Phthon 库被称为 Theano,能够实现 CUDA 加速计算,并充分利用 NVIDIA 的最新技术。

创伤区域大脑切片。
创伤区域大脑切片。

通过使用各种 GeForce GTX 显卡的扩展内存,该团队得以在更大的网络中进行试验。最近,他们在研究实验室里部署了一个具有 16 个 NVIDIA Tesla K80 GPU 加速器的集群,进一步推动了研究进展。

Glocker 说:“GPU 能实现快速、高效的算法运算,而且为这种类型的图像分析提供了正确的硬件架构,没有它,我们做不到这一点。使用 GPU 分析一张大脑扫描图像只需要两分钟,而如果没有它,则可能花费好几个小时。”

使用 GPU 能够自动检测和分割与创伤性脑损伤相关的大脑病灶,其效果胜过其他非常先进的分割系统。由于该团队的工作能够促进医学成像的临床研究,而且直接影响到诊断和治疗,因此他们正在与多家研究机构和医院合作。

剑桥大学麻醉学院院长 David Menon 教授表示,Glocker 及其团队的研究成果“有助于转变人们使用核磁共振成像 (MRI) 开发和实践创伤性脑损伤治疗方法的范式”。

该团队发现,他们的方法对治疗中风患者和脑瘤病人有良好的效果,而且还能用于心脏和胎儿成像。

2016 年度全球影响力大奖得主将在 4 月 4-7 日于硅谷举办的 GPU 技术大会上公布。

了解更多 2016 年度全球影响力大奖入围者

全球影响力:借助 GPU 更精确地监控海平面上升情况

全球影响力:GPU 如何帮助眼外科医生在手术室里将视野范围扩大到 20/20

全球影响力:如何借助 GPU 根据海底地震的启示找到绘制安全结构图的新方法

了解上一年度 NVIDIA 全球影响力大奖得主的研究成果